Το Αυτοτελές Τμήμα Εσωτερικού Ελέγχου της Περιφέρειας Δυτικής Μακεδονίας συστάθηκε με την υπ’ αριθμ. 6405/11-02-2022 (ΦΕΚ Β΄ 563/11-02-2022) απόφαση του ΠΣ Δυτικής Μακεδονίας ως αυτοτελής και ανεξάρτητη υπηρεσία, η οποία διοικητικά οργανώνεται σε επίπεδο λειτουργίας Τμήματος με έδρα την Κοζάνη, υπάγεται απευθείας στον Περιφερειάρχη Δυτικής Μακεδονίας και ασκεί τις λειτουργίες του εσωτερικού ελέγχου (Internal Audit).
Σκοπός του Αυτοτελούς Τμήματος Εσωτερικού Ελέγχου είναι ο έλεγχος των συστημάτων διακυβέρνησης, αξιολόγηση της λειτουργίας, των δραστηριοτήτων και των προγραμμάτων του φορέα με σκοπό την υποστήριξή του για την επίτευξη των στρατηγικών του στόχων και για τη λήψη μέτρων, όπου απαιτείται, ώστε να προλαμβάνονται και να αποκαθίστανται διοικητικές και οργανωτικές λειτουργίες.